Стратегическая задача Научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии направлена на развитие высокоспециализированной медицинской помощи, эффективное использование ресурсов, улучшение качества медицинской помощи, внедрение новых репродуктивных методов и технологий, разработка научно-исследовательских программ с последующим внедрением результатов исследований в практическое здравоохранение с целью снижения материнских и плодовых потерь.